Не так давно в гугло-админке появился новый способ подтверждения прав собственности на домен - "Добавить запись DNS". В некоторых случаях (хитрые движки с хитрыми шаблонами и хитрыми настройками .htaccess) - просто единственный выход.
На скриншоте показывается, как это сделать на примере достаточно распространённой панели управления DirectAdmin. Заходим в закладку "Редактирование DNS настроек" и в окне "Добавление записи домена" в поле TXT пишем ваш домен - с точкой на конце и проверочную строку от Гугле - обязательно в кавычках. Тискаем "Добавить", после через некоторое время (минуту-другую уйдёт на применение) тискаем в гугло-админке "Проверить" и радуемся.

п.с. Возможно монстры по части администрирования меня поправят на счёт синтаксиса, но с другими вариантами (без кавычек, в частности) - у меня не получилось.